Pile-ups (DNA-Genealogie)

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Als Pile-ups werden in der DNA-Genealogie Regionen bzw. Segmente auf den autosomalen Chromosomen bezeichnet in denen sehr viele Matche auftreten, die jedoch meistens unter 7 cM liegen.

Bei Matche, die in diesen Regionen auftreten handelt es sich häufig um falsche Matche, die entstehen, weil der Match zwischen dem mütterlichen und dem väterlichen Chromosom hin- und herspringt (Zick-Zack-Match). Bei einem gephasten Datensatz ist dann kein Match vorhanden.


Ob Matche in den Bereichen der nachfolgenden Tabelle angezeigt werden, ist auch abhängig von dem Testanbieter, da andere Positionen getestet werden und teilweise ein fehlerhafter Algorithmus angewendet wird.


So werden z.B. beim Testanbieter MyHeritage am Anfang von Chromosom 15 Matche angezeigt, obwohl zu wenige Positionen getestet sind. Nachfolgend vier Beispiele:

Positionen 20.004.966 bis 22.852.884 - 14,1 cM, 128 SNPs, es werden jedoch nur 38 SNPs getestet.

Positionen 20.004.966 bis 23.004.417 - 14,7 cM, 256 SNPs, es werden jedoch nur 94 SNPs getestet.

Positionen 20.004.966 bis 23.683.783 - 19,5 cM, 384 SNPs, es werden jedoch nur 137 SNPs getestet.

Positionen 20.004.966 bis 23.890.279 - 20,1 cM, 512 SNPs, es werden jedoch nur 197 SNPs getestet.

Die getesteten SNPs können sich durch No-calls um ca. 10% verringern.


Artikel wird demnächst ergänzt.


Bekannte Pile-ups Regionen

Chromosom Startposition Endposition Centimorgan
1 118.434.520 153.401.108 10,0
2 85.304.243 99.558.013 6,5
2 132.695.025 141.442.636 9,2
2 192.352.906 198.110.229 5,0
8 10.428.647 13.469.693 8,0
9 38.293.483 72.605.261 8,2
10 44.555.093 53.240.188 7,6
15 20.060.673 25.145.260 10,5
15 27.115.823 30.295.750 9,3
16 19.393.068 24.031.556 6,2
17 59.518.083 64.970.531 6,2
17 77.186.666 78.417.478 5,7
21 16.344.186 19.375.168 6,9
22 16.051.881 25.095.451 20,8


Anmerkungen


Die Doppelhelix der DNA
Weitere Informationen zur DNA-Genealogie siehe Portal:DNA-Genealogie
1-zu-1-Vergleich zweier DNA-Kits bei Gedmatch.com
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